В 1940-м году Италия вступила во Вторую Мировую войну на стороне нацистской Германии. Вновь, как и во время предыдущего глобального военного конфликта, начался массовый призыв в армию, коснувшийся и футболистов. Колаусси, Локателли, Меацца, Пиоли, братья Сентименти, Маньи, Лушта, Габетто, Парола и Виола – эти игроки «Ювентуса» были вынуждены сменить футбольную форму на армейскую.
Но, несмотря на войну, правительство Муссолини приняло решение не прекращать официальные спортивные соревнования, в том числе и национальное первенство по футболу. Чемпионат проводился вплоть до 1943 года, когда Италия оказалась разделенной между войсками союзников и немецкой армией. Таким образом, были сыграны три сезона, наивысшим достижением в которых для «Ювентуса» стало третье место (1942/1943) и вторая победа в Кубке Италии (1941/1942).
Зимой 1942 года Турин подвергся бомбардировке, и Пьеро Дусио, тогдашний президент «Ювентуса», принял решение перевезти команду в более безопасное место – в городок Альба. «Альбийский» период своей истории клуб провел под названием «Ювентус Цизиталия» (Juventus Cisitalia); примечательно, что в это время «бьянконери» приютили и тех игроков, которые из-за войны оказались вне расположения своих команд. Несмотря на прекращение национального первенства, в период 1943-1945 годов продолжали проводиться различные локальные турниры, в частности, чемпионат среди команд севера и центра Италии, в котором принял участие и «Ювентус». Помимо этого, в военные годы «ювентини» провели целый ряд товарищеских матчей с земляками из «Торино».